5'-荧光素亚磷酰胺不包含4,4'-二甲氧基三苯甲基（DMT）基团，并且只能在5'末端添加一次，从而终止合成。该产物是使用6-羧基荧光素衍生物制备的。四氯（TET）-，六氯（HEX）-和二氯-二甲氧基（JOE）-荧光素亚磷酰胺的设计旨在利用现代DNA测序仪和遗传分析仪的多色检测功能。荧光素亚磷酰胺被设计为产生与先前使用异硫氰酸荧光素（FITC）制备的荧光素型结构相同的荧光素。我们的荧光素亚磷酰胺还包含DMT基团，可定量偶联。使用6-FAM制备的类似结构6-荧光素亚磷酰胺也可与6-荧光素丝氨醇亚磷酰胺一起获得。可以将荧光素-dT插入所需序列中，以替代dT残基。

我们提供五种荧光素支持物。传统上，荧光素CPG用于在3'末端添加荧光素标记。使用6-FAM制备的类似结构的3'-（6-荧光素）CPG，以及6-荧光脂丝氨酸CPG也已上市。我们还提供3'-（6-FAM）CPG和Fluorescein-dT CPG，它们都是6-羧基荧光素（6-FAM）的衍生物。两者都是单一异构体，并使用酰胺键，该酰胺键在裂解和脱保护过程中是稳定的，并且不允许异构体形成。 3'-（6-FAM）CPG可以有效阻止聚合酶延伸以及核酸外切酶消化3'-末端。荧光素-dT CPG允许这两种酶的活动继续进行。正常的切割和用氢氧化铵的脱保护很容易产生荧光素标记的寡核苷酸。

一般性质